procedure


ISTRUZIONI PER L'ACCESSO AL SERVIZIO DI "MUTATION DETECTION"

La richiesta deve essere inviata per e-mail a DNATEST@vincenzonigro.it e in cc a facilities@telethon.it

Va preparata secondo lo schema seguente:
Nell'oggetto va indicato: MUTATION DETECTION, il nome del titolare del progetto (ad esempio: MUTATION DETECTION, NOME)
MUTATION DETECTION
NOME: es BANFI
eMAIL: banfi@tigem.it
DATA: 25/01/07
GENE-ESONE: FGRFR3-4 (sigla del gene-numero dell'esone)
SEQUENZA: (introne-ESONE-introne)
es gaattcccctcagGTAGTAGCTTTCAGTTCGCGTAATCGTAGATGCATGCAGGgtaagcttggcaaga
SAMPLES (per provette da 0.2, piastre da 96-well o 384-well):
CONTROLLO NORMALE (necessario, almeno 50 microliters)
CONTROLLO MUTATO (se esiste)
DYS-44/MH12
DYS-44/MH27
DYS-44/MH44
DYS-44/MNP22

E' importantissimo compilare la lista dei campioni scaricando il file Excel allegato (sia per i tubi sia per le micropiastre), in quanto il software consente l'introduzione diretta della lista evitando errori di battitura.
Le PCR devono essere effettuate in tubi da 0.2ml o micropiastre da 96 o 384.
Il volume minimo di PCR è 50 microlitri per il controllo e 25 microlitri per i campioni.
Le reazioni possono essere effettuate con la TaqGold (AB) o prodotto equivalente ultilizzando il buffer10x presente nella confezione della Taq Gold oppure il buffer LB 10x (TRIS base 100mM, HEPES acido 100mM, KCl 100mM, Solfato di ammonio 100mM, Cloruro di magnesio 15mM) senza olio minerale. Ogni altra possibile aggiunta (detergenti, DMSO, BSA, gelatina etc.) alla PCR è da evitare.
Se il controllo non è visibile o è contaminato da prodotti aspecifici nessun campione della stessa serie sarà caricato. Il controllo si può anche far pervenire con qualche gorno di anticipo oppure "una tantum", a patto che nel frattempo non si cambi il protocollo.



I campioni possono essere inviati via corriere all'attenzione di Mutation Detection/prof Vincenzo Nigro, via Luigi De Crecchio, 7 80138 - Napoli- tel 0815667563/663 fax 0815665704





Telethon Research Service/Core Facility GTF06006 Director: Vincenzo Nigro

Mutation Detection Service – CGA, Seconda Università di Napoli

SERVICE ACKNOWLEDGEMENT FORM

Investigator (User)
Institute
Address
Phone number
Fax number
e-mail address

Telethon Project number

I hereby acknowledge receipt of the services listed below,

______________________________________ Progressive number of service:________
Name and Signature of Investigator (USER)

Place____________________ Receipt Date______________________

Service Code and Type Experiment Description Service Unit Provided Units Delivery Date Full Cost
01 – Single fragment analysis injection €
Total amount €
Charged to the user (35 %) €
Reimbursed by Telethon (65%) €

02 – Optimization of DHPLC analysis for a new fragment job
Total amount €
Charged to the user (100 %) €

Telethon Research Service/Core Facility GTF06006 Director: Vincenzo Nigro

Mutation Detection Service – CGA, Seconda Università di Napoli


SERVICE DESCRIPTION AND RATES

Service Code and Type Rate/Service Unit Amount reimbursed by Telethon for Telethon jobs
(80% of full cost)
Full cost for academic users Reduced cost for Telethon users (35% of full cost)
01 – Single fragment analysis
Injection of a fragment onto DHPLC and post-analysis processing of results 1,50 €/injection 0,52 €/injection 0,98 €/injection
02 – Otimization of DHPLC analysis for a new fragment
Empirical set up of optimal conditions for temperature, eluent concentrations, ets.

Note: this service is not supported by Telethon 15,00 €/job - -